Bencana dahsyat terjadi 1000 tahun yang lalu menyebabkan hampir seluruh manusia di Bumi tewas dan menyisakan beberapa yang berhasil lolos dan hidup. Mereka kini tinggal di sebuah tempat yang bernama Nova Prime.
Aktor kawakan Will Smith beradu akting kembali dengan anaknya Jaden Smith yang beranjak dewasa.
Berawal dari Jenderal Cypher Raige yang akan menemui anaknya Kitai Raige , tiba-tiba pesawat yang mereka tumpangi terkena badai asteroid dan menyebabkan kerusakan yang sangat parah dan membuat Cypher terluka.
Mereka pun akhirnya jatuh ke Bumi dengan keadaan yang sangat berbeda dengan seribu tahun lalu. Kitai harus mencari tempat penyelamatan untuk menolong sang ayah yang sedang sekarat di kokpit. Kitai pun mencari bantuan untuk menolong ayah dan dirinya sendiri.
Di Bumi yang baru itu, mereka harus menghadapi ancaman dan gangguan dari spesies hewan aneh yang mendominasi planet ini dan juga makhluk – makhluk aneh yang belum pernah mereka lihat sebelumnya.